Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem39aQ9CYC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem39aQ9CYC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms