Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins3Q9CY94 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins3Q9CY94 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins3Q9CY94 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins3Q9CY94 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins3Q9CY94 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins3Q9CY94 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gins3Q9CY94 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gins3Q9CY94 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gins3Q9CY94 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins3Q9CY94 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms