Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Rpl11Q9CXW4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms