Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Malsu1Q9CWV0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms