Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tdrd12Q9CWU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tdrd12Q9CWU0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tdrd12Q9CWU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd12Q9CWU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms