Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnbl1Q9CWL8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnbl1Q9CWL8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnbl1Q9CWL8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnbl1Q9CWL8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnbl1Q9CWL8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnbl1Q9CWL8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnbl1Q9CWL8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms