Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sppl3Q9CUS9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sppl3Q9CUS9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sppl3Q9CUS9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms