Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fcf1Q9CTH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fcf1Q9CTH6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fcf1Q9CTH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fcf1Q9CTH6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms