Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rprd1bQ9CSU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rprd1bQ9CSU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rprd1bQ9CSU0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms