Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tm7sf3Q9CRG1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tm7sf3Q9CRG1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tm7sf3Q9CRG1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms