Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CRC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9CRC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CRC3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9CRC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms