Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NmbQ9CR53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NmbQ9CR53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms