Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufab1Q9CR21 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufab1Q9CR21 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ndufab1Q9CR21 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms