Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pop4Q9CR08 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pop4Q9CR08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms