Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ykt6Q9CQW1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ykt6Q9CQW1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms