Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR6

Ppp6c, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6cQ9CQR6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp6cQ9CQR6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppp6cQ9CQR6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppp6cQ9CQR6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms