Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccer1Q9CQL2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccer1Q9CQL2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms