Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rdm1Q9CQK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rdm1Q9CQK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rdm1Q9CQK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms