Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ergic3Q9CQE7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ergic3Q9CQE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ergic3Q9CQE7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms