Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ubl4bQ9CQ84 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ubl4bQ9CQ84 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ubl4bQ9CQ84 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ubl4bQ9CQ84 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ubl4bQ9CQ84 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms