Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chmp3Q9CQ10 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chmp3Q9CQ10 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chmp3Q9CQ10 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chmp3Q9CQ10 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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