Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sike1Q9CPR7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sike1Q9CPR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sike1Q9CPR7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sike1Q9CPR7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms