Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd4Q9CPR1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd4Q9CPR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd4Q9CPR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd4Q9CPR1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd4Q9CPR1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd4Q9CPR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd4Q9CPR1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms