Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf8Q99PV0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf8Q99PV0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf8Q99PV0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms