Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn6Q99PL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn6Q99PL6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn6Q99PL6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms