Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trem2Q99NH8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem2Q99NH8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trem2Q99NH8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms