Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pbx4Q99NE9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pbx4Q99NE9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pbx4Q99NE9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pbx4Q99NE9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbx4Q99NE9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms