Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b1Q99NB9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3b1Q99NB9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sf3b1Q99NB9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms