Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KarsQ99MN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KarsQ99MN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KarsQ99MN1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 922.8 ms