Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr3Q99MB1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr3Q99MB1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlr3Q99MB1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr3Q99MB1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms