Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Chmp1b1Q99LU0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b1Q99LU0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chmp1b1Q99LU0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms