Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clp1Q99LI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clp1Q99LI9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clp1Q99LI9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clp1Q99LI9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms