Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nmd3Q99L48 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nmd3Q99L48 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nmd3Q99L48 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nmd3Q99L48 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms