Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmp1Q99KU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vmp1Q99KU0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmp1Q99KU0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.5 ms