Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pls3Q99K51 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pls3Q99K51 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pls3Q99K51 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pls3Q99K51 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms