Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrabdQ99JY4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrabdQ99JY4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrabdQ99JY4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrabdQ99JY4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms