Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd6Q99JI4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd6Q99JI4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms