Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trps1Q925H1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trps1Q925H1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms