Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smc6Q924W5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc6Q924W5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc6Q924W5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms