Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf7Q922B6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Traf7Q922B6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Traf7Q922B6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf7Q922B6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms