Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Odf3Q920N1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Odf3Q920N1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Odf3Q920N1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms