Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med28Q920D3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med28Q920D3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med28Q920D3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.5 ms