Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Smarca5Q91ZW3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca5Q91ZW3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca5Q91ZW3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms