Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y19

Pcdha11, Protocadherin alpha 11, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha11Q91Y19 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha11Q91Y19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha11Q91Y19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha11Q91Y19 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha11Q91Y19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms