Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha9Q91Y11 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha9Q91Y11 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms