Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb12Q91Y07 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb12Q91Y07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdhb12Q91Y07 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb12Q91Y07 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms