Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vps36Q91XD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vps36Q91XD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps36Q91XD6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms