Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itm2cQ91VK4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itm2cQ91VK4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itm2cQ91VK4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itm2cQ91VK4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itm2cQ91VK4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itm2cQ91VK4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms