Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TraipQ8VIG6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TraipQ8VIG6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TraipQ8VIG6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TraipQ8VIG6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms