Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nle1Q8VEJ4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nle1Q8VEJ4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nle1Q8VEJ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nle1Q8VEJ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms